本尊指挥设置天赋树系统，5-10级开始激活，每2-3级提供一个天赋点：比如弹道专精5级，每级增加本ID所有弹道武器伤害4%，可与指挥官技能叠加（其他三系类推）；防御专精5级，每集减少本ID所有舰队受到伤害的3%，可与指挥官技能叠加；要塞学5级，每级增加星球HP10%；后勤学5级，每级减少3%跃迁时间；工业革命5级，每级减少本ID所有造舰时间2%；科技革新5级，每级提高本ID科技总产量2%；资源整合5级，每级增加所有资源产量2%（因为T和L效率远远不如H,所以三系资源就不分开了，以免制造垃圾天赋）；20级设置一些强力战斗天赋供选择（只能选择一个），比如击退、沉默、恐惧、嘲讽、吸血、法力燃烧等；30级设置一些强力后勤天赋供选择，比如建筑速度提升20%、非战斗部队0跃迁消耗、奖励874星球一个等等；40级设置终极天赋供选择，比如强制提升本势力修正2%（不叠加，可突破45%上线，而-14可以变成-12保底），可为本势力激活特殊船体/组件等等。轮回结束重置天赋点，可花荣誉洗天赋。
